L'AICS di Ouagadougou, nella realizzazione delle iniziative finanziate dalla Cooperazione italiana, si avvale di una fitta rete di partner locali, internazionali e della società civile. Tra questi le istituzioni e i ministeri burkinabé e ghanesi, coinvolti nelle iniziative progettuali, rappresentano senz'altro degli interlocutori privilegiati, così come il Ministero degli Affari Esteri e della Cooperazione Internazionale (MAECI) in Italia.
Nell'universo della società civile, partner rilevanti dell'AICS di Ouagadougou sono le ONG italiane che lavorano sul territorio anche da diversi anni e rappresentano un capitale, in termini di conoscenza del contesto e di memoria storica, fondamentale.
Rilevante è inoltre l'apporto, sulle iniziative afferenti al canale multilaterale, degli organismi internazionali e delle agenzie delle Nazioni Unite e stanno acquisendo sempre più importanza le partnership tecniche legate ad istituti di ricerca e alle Università.