Le siège de l'AICS de Ouagadougou, rouvert en 2013 suite à la signature de l'Accord-cadre de coopération par le Ministre de la Coopération Internationale Andrea Riccardi et le Ministre des Affaires Etrangères burkinabé Djibril Bassolé, est responsable des initiatives de coopération et d'urgence au Burkina Faso et au Ghana.
Les deux pays sont des partenaires historiques de la Coopération italienne : en plus de 25 ans d'interventions, le Burkina Faso, pays prioritaire, a reçu 107 millions d'euros sous forme de dons, tandis qu'au Ghana, les interventions se concentrent sur le renforcement du secteur privé et la création d'emplois à travers un programme de crédit d'aide.
L'engagement de la Coopération italienne au Burkina Faso se déroule traditionnellement dans les secteurs de la santé et du développement rural, ainsi que dans le cadre d'initiatives d'urgence. Son rôle de premier plan en tant que pays prioritaire dans le contexte de la région du Sahel confirme la volonté de l'Italie de s'engager au Sahel et de renforcer son soutien dans les secteurs traditionnels de la santé et du développement rural, mais aussi dans les domaines de la formation professionnelle, de la création d'emplois et de l'inclusion du genre et des personnes vivant avec un handicap. Outre le secteur du développement rural, la coopération italienne a joué par le passé un rôle de premier plan dans la lutte contre la désertification dans le pays.
En outre, compte tenu de la mosaïque complexe d'insécurité et des conséquences du changement climatique qui affectent le pays, la Coopération italienne oriente également ses initiatives vers le secteur de l'urgence.
Jusqu'à l'ouverture du bureau AICS à Niamey en 2023, le bureau de Ouagadougou était également responsable du Niger.
